在PCR（聚合酶鏈式反應）生物實驗中，常用的染料根據用途主要分為以下幾類：

一、核酸電泳染色染料（用于檢測PCR產物）

1、溴化乙錠（Ethidium Bromide, EtBr）

傳統的核酸染料，與DNA結合后在紫外光下發出橙紅色熒光。

注意：有潛在致癌性，需謹慎操作。

2、SYBR系列染料（如SYBR Green I/SYBR Gold）

靈敏度高于EtBr，更安全（但仍需防護），需避光保存。

SYBR Green I也常用于實時熒光定量PCR（qPCR）。

3、GelRed/GelGreen

安全性更高（無誘變性），靈敏度與EtBr相當，需紫外或藍光激發。

其他替代染料：如SYBR Safe、EvaGreen（也可用于qPCR）等。

二、實時熒光定量PCR（qPCR）染料

1、SYBR Green I

非特異性結合雙鏈DNA，通過熒光強度定量產物，需配合熔解曲線分析。

2、EvaGreen

類似SYBR Green，但熒光信號更強，適用于高分辨率熔解曲線分析（HRM）。

3、探針類染料（需特異性設計探針）

TaqMan探針：基于熒光共振能量轉移（FRET），標記報告基團（如FAM）和淬滅基團。

分子信標（Molecular Beacon）：發夾結構探針，特異性高。

三、其他輔助染料

1、Loading Dye（上樣緩沖液染料）

如溴酚藍（Bromophenol Blue）或二甲苯青（Xylene Cyanol），用于電泳時指示遷移進度。

2、DNA ladder標記染料

預染的DNA分子量標準（如預混SYBR Green或EtBr）。

根據實驗需求（如常規檢測、定量、安全性等）選擇合適的染料即可。