QuantStudio 1是一個靈活的平臺，支持多種化學檢測方法。總的來說，可以分為兩大類：DNA結合染料 和水解探針。

一、賽默飛QuantStudio1實時熒光定量PCR系統DNA結合染料

這類染料可以嵌入任何雙鏈DNA分子中，發出熒光，因此是一種非特異性的檢測方法。它成本較低，但無法區分特異性產物和非特異性產物（如引物二聚體）。

1、SYBR Green I：這是經典、常用的DNA結合染料。當它與雙鏈DNA結合后，熒光信號會大大增強。實驗結束后，需要通過熔解曲線分析 來確認擴增產物的單一性。

2、EvaGreen：一種對PCR抑制更小、穩定性更好的染料，尤其適合高分辨率熔解曲線分析。

二、賽默飛QuantStudio1實時熒光定量PCR系統水解探針

這類方法利用一個序列特異性的探針，因此是特異性的檢測。它通過熒光共振能量轉移原理來工作，只有在擴增出目標序列時才會報告熒光信號，特異性高，適合進行多重檢測（同時檢測多個目標）。

1、TaqMan 探針：這是賽默飛世爾科技（Applied Biosystems）的技術，也是與QuantStudio系統最“原配"的探針化學方法。在探針的5‘端帶有一個報告熒光基團，在3’端帶有一個淬滅基團。

2、TaqMan探針常用的染料組合非常豐富，可以分為以下幾類：

（1）經典的組合是 FAM（報告基團） 搭配 TAMRA 或 MGB-NFQ（淬滅基團）。

（2）現在主流、效果好的是使用MGB探針，其淬滅基團通常是非熒光淬滅基團，能獲得更低的背景和更高的信噪比。例如：FAM-MGB-NFQ。

注意：在設置多重實驗時，必須確保您儀器配置的光源和濾光片組支持您所選擇的染料組合。QuantStudio 1的標準配置通常支持FAM、VIC、ROX等常見染料。

三、總結建議

1、查看儀器配置：首先確認您的QuantStudio 1具體配置了哪些激發光源和檢測濾光片，以確保您選擇的染料能被儀器識別。

2、實驗目的決定方法：

（1）如果只是看某個基因的表達量變化，且預算有限，SYBR Green 是重要選擇。

（2）如果需要進行高精度的定量（如病毒載量），或檢測高度同源的序列，或在一個樣本中同時檢測多種病原體，請選擇TaqMan探針。

3、使用預混液：強烈建議使用賽默飛配套的預混液，如 PowerUp SYBR Green Master Mix (用于SYBR Green法) 或 TaqMan Universal Master Mix (用于TaqMan探針法)。這些預混液已經優化好，包含了除引物、模板和探針外的所有成分，能保證實驗的穩定性和重復性。