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技術(shù)文章

biorad伯樂(lè)CFX Opus96實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀正確操作使用方法

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伯樂(lè)Bio-Rad CFX Opus 96實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀的正確操作使用方法。這是一份詳細(xì)的、分步驟的操作指南,旨在幫助您安全、準(zhǔn)確、高效地使用該儀器。


一、伯樂(lè)CX OPUS96實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀實(shí)驗(yàn)前準(zhǔn)備

1、儀器準(zhǔn)備

開(kāi)機(jī):打開(kāi)儀器主機(jī)電源,再打開(kāi)電腦。啟動(dòng) CFX Maestro 軟件。儀器會(huì)進(jìn)行自檢,確保所有指示燈正常。

預(yù)熱:儀器開(kāi)機(jī)后預(yù)熱10-15分鐘,使光學(xué)系統(tǒng)和加熱模塊穩(wěn)定。

2、軟件準(zhǔn)備

在電腦上雙擊打開(kāi) CFX Maestro 軟件。

創(chuàng)建新實(shí)驗(yàn):點(diǎn)擊 New Experiment 或 Create Experiment。

3、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)

明確您的實(shí)驗(yàn)?zāi)康模憾俊⑾鄬?duì)定量(基因表達(dá)分析)、基因分型等。

設(shè)計(jì)好您的實(shí)驗(yàn)布局(板布局),包括:

待測(cè)樣品:每個(gè)樣品設(shè)置技術(shù)重復(fù)(通常2-3個(gè))。

標(biāo)準(zhǔn)品(用于定量):一系列已知濃度的DNA/cDNA,用于生成標(biāo)準(zhǔn)曲線。

陰性對(duì)照:

無(wú)模板對(duì)照:反應(yīng)體系中不加任何模板,用于檢測(cè)試劑或環(huán)境是否存在污染。

無(wú)逆轉(zhuǎn)錄對(duì)照:僅用于基因表達(dá)分析,檢測(cè)基因組DNA污染。

內(nèi)參基因(用于相對(duì)定量):用于校正樣品間的加樣量和RNA質(zhì)量差異。

4、反應(yīng)體系配制(在冰上或冷卻板上操作)

根據(jù)您的試劑盒說(shuō)明書(shū)或自行優(yōu)化的方案,計(jì)算并配制 主混合液。

推薦配制順序:在一個(gè)1.5 mL無(wú)菌無(wú)核酸酶離心管中,按以下順序加入:

無(wú)核酸酶水

PCR緩沖液、Mg2?等

dNTPs

引物 和 探針(如使用)

熱啟動(dòng)DNA聚合酶(最后加入,避免室溫下非特異性擴(kuò)增)

充分混勻并短暫離心。

將主混合液分裝到PCR板或八聯(lián)管中。

最后在指定的模板添加區(qū)加入模板DNA/cDNA,蓋上管蓋/板膜。

短暫離心PCR板/八聯(lián)管,確保所有液體沉于管底且無(wú)氣泡。


二、伯樂(lè)CFX OPUS96實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀上機(jī)操作流程

1、步驟1:放置樣品

打開(kāi)儀器的樣品槽門(mén)。

如果是96孔板:將其平穩(wěn)地放入樣品槽中,確保板子放置平整,A1孔位于左上角。

如果是八聯(lián)管:確保所有管子擺放整齊,卡在支架上,位置正確。

輕柔地關(guān)上樣品槽門(mén)。

2、步驟2:在CFX Maestro軟件中設(shè)置實(shí)驗(yàn)

(1)選擇檢測(cè)類(lèi)型:

點(diǎn)擊 Assay -> Select。

對(duì)于SYBR Green I染料:選擇 SYBR® Green。

對(duì)于TaqMan探針:選擇 FAM 或其他相應(yīng)的熒光染料。

對(duì)于HRM分析:選擇 HRM。

(2)設(shè)置板布局:

在虛擬的96孔板界面上,用鼠標(biāo)拖動(dòng)選擇孔位。

為選中的孔位指定 樣品名稱(chēng) 和 任務(wù)。

任務(wù)類(lèi)型包括:

Unknown:未知樣品。

Standard:標(biāo)準(zhǔn)品,并需要輸入其濃度。

NTC:無(wú)模板對(duì)照。

Positive Control:陽(yáng)性對(duì)照。

(3)編輯實(shí)驗(yàn)協(xié)議:

點(diǎn)擊 Protocol 進(jìn)入編輯界面。一個(gè)典型的qPCR程序包括三個(gè)階段:

a. 預(yù)變性/熱啟動(dòng):

溫度:95°C

時(shí)間:2-5分鐘(根據(jù)酶的要求,激活熱啟動(dòng)酶并確保模板變性)。

b. 擴(kuò)增循環(huán)(重復(fù)40-45個(gè)循環(huán)):

變性:95°C,10-30秒。

退火/延伸:60°C(常用),30-60秒。在此步驟采集熒光信號(hào)。

注意:如果引物Tm值較低,可能需要分開(kāi)設(shè)置退火和延伸步驟。

c. 熔解曲線分析(僅適用于SYBR Green I):

儀器會(huì)自動(dòng)生成一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)熔解曲線程序,通常為:

95°C,10秒

65°C,5秒

然后從65°C緩慢升溫到95°C,每0.5°C采集一次熒光信號(hào)。

3、步驟3:?jiǎn)?dòng)運(yùn)行

保存實(shí)驗(yàn)文件:為您的實(shí)驗(yàn)命名并保存(.pcrd 文件)。

點(diǎn)擊 Start Run。

軟件會(huì)彈出一個(gè)對(duì)話框,讓您再次確認(rèn)板布局和實(shí)驗(yàn)協(xié)議。確認(rèn)無(wú)誤后,點(diǎn)擊 開(kāi)始。

儀器將開(kāi)始運(yùn)行,您可以在軟件界面上實(shí)時(shí)查看反應(yīng)進(jìn)程、擴(kuò)增曲線和溫度狀態(tài)。


三、伯樂(lè)CFX OPUS96實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀運(yùn)行后數(shù)據(jù)分析

1、查看擴(kuò)增曲線:

確保所有陽(yáng)性樣品的擴(kuò)增曲線呈標(biāo)準(zhǔn)的“S"型,基線平穩(wěn),指數(shù)期明顯。

檢查NTC對(duì)照是否有擴(kuò)增信號(hào)(應(yīng)無(wú)或Ct值>35),如有則表明存在污染。

2、查看熔解曲線(SYBR Green I):

確保每個(gè)樣品只有一個(gè)單一的、尖銳的峰。出現(xiàn)多個(gè)峰或?qū)挿灞砻饔幸锒垠w或非特異性擴(kuò)增。

3、進(jìn)行定量分析:

定量:軟件會(huì)根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)品自動(dòng)生成標(biāo)準(zhǔn)曲線(R2 > 0.99,效率在90%-110%之間為佳),并計(jì)算出未知樣品的起始拷貝數(shù)或濃度。

相對(duì)定量(ΔΔCt法):

軟件會(huì)先計(jì)算每個(gè)樣品的內(nèi)參基因(管家基因)和目標(biāo)基因的Ct值。

然后通過(guò) ΔCt = Ct(目標(biāo)基因) - Ct(內(nèi)參基因),ΔΔCt = ΔCt(實(shí)驗(yàn)組) - ΔΔCt(對(duì)照組),最終計(jì)算出 2^(-ΔΔCt),即基因表達(dá)的相對(duì)倍數(shù)變化。

4、導(dǎo)出數(shù)據(jù):可以將圖表和數(shù)據(jù)(如Ct值、濃度等)導(dǎo)出為Excel或PDF格式,用于報(bào)告和存檔。

TEL:18016231680

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