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伯樂(Bio-Rad)S1000是一款經典的96孔梯度PCR儀,性能穩定可靠。其耗材和試劑的選擇與其他標準PCR儀類似,但有一些品牌有的推薦和注意事項。以下是使用伯樂S1000梯度PCR儀所需的耗材和試劑清單及選擇指南:
一、伯樂S1000梯度PCR儀核心耗材
1、PCR板或管
(1)類型:必須使用0.2 ml規格的PCR板或單管/聯管。
(2)與儀器的匹配性:
推薦:伯樂原裝或認證的耗材(如硬質96孔PCR板),以確保與熱蓋壓力和導熱塊接觸,獲得最準確的溫度控制。
通用:大多數市售的標準96孔PCR板(平蓋或凸蓋)和0.2 ml單管/8聯管均可使用。
(3)材質:推薦使用聚丙烯材質,導熱性好,耐高溫。
封蓋:
(4)熱蓋:如果使用PCR儀的熱蓋功能,必須使用平蓋的PCR板或管。
封板膜:如果不使用熱蓋,或樣本有蒸發風險(如長期循環),需使用透明的光學封板膜進行密封。確保封板膜能耐受高溫(通常可至120°C以上)。
2、封板膜(可選)
如上所述,用于密封PCR板。選擇粘性好、密封性強、無PCR抑制劑的光學封板膜。
二、伯樂S1000梯度PCR儀核心試劑
1、PCR預混液
(1)常用和方便的選擇。通常包含:
(2)熱啟動DNA聚合酶:如Taq酶、高保真酶等。
(3)dNTPs:四種脫氧核苷酸混合物。
(4)反應緩沖液:含Mg2?(鎂離子濃度可能可調)。
(5)優化劑和穩定劑。
2、品牌:可選擇伯樂自家的SsoAdvanced系列、iTaq系列等預混液,也可以使用其他品牌(如NEB、Takara、Thermo Fisher等)的預混液,需確保其反應體系與程序兼容。
3、自配PCR反應體系
如果您習慣于自行配制,需要準備以下獨立組分:
(1)PCR緩沖液(10X或5X):提供合適的pH和鹽離子環境。
(2)MgCl溶液:鎂離子濃度對PCR特異性影響重大,梯度PCR儀特別適合優化此條件。
(3)dNTP Mix。
(4)正向引物和反向引物。
(5)DNA模板。
(6)DNA聚合酶。
(7)無菌去離子水。
4、陽性對照與陰性對照
(1)陽性對照:含有已知目標序列的DNA模板,用于驗證整個反應體系正常。
(2)陰性對照(無模板對照,NTC):用等體積水替代DNA模板,用于檢測試劑或環境是否存在污染。
三、伯樂S1000梯度PCR儀輔助耗材與試劑
1、移液器及無菌吸頭:用于精確分裝試劑,需保證無核酸酶污染。
2、離心機:用于在將板/管放入PCR儀前,離心混勻并收集管壁液滴。
3、冰盒:在配制反應體系時保持試劑低溫,防止非特異性擴增。
4、無核酸酶水:用于稀釋或調整反應體積。
5、樣品板/管架:方便操作。
四、伯樂S1000梯度PCR儀選擇建議總結
1、追求性能和兼容性:選擇伯樂原裝的0.2 ml硬質PCR板和其推薦的預混液。
2、常規使用,控制成本:選擇市面上可靠品牌的平蓋0.2 ml PCR板和性能穩定的預混液(需經過驗證)。
3、進行梯度優化實驗:
務必使用成分均一的主混合液。
實驗設計時,在板上合理安排不同溫度或條件的樣本位置。
最后建議:
閱讀 《伯樂S1000用戶手冊》,其中會有推薦的耗材型號和詳細的實驗設置指南。
在開始重要的梯度優化實驗前,先用已知模板和引物進行常規PCR測試,以確認整個系統(儀器+耗材+試劑)工作正常。